Ontology-Based Data Access and Integration

An ontology-based data integration (OBDI) system is an information management system consisting of three components: an ontology, a set of data sources, and the mapping between the two. The ontology is a conceptual, formal description of the domain of interest to a given organization (or a community of users), expressed in terms of relevant concepts, attributes of concepts, relationships between concepts, and logical assertions characterizing the domain knowledge. The data sources are the repositories accessible by the organization where data concerning the domain are stored. In the general case, such repositories are numerous, heterogeneous, each one managed and maintained independently from the others. The mapping is a precise specification of the correspondence between the data contained in the data sources and the elements of the ontology. The main purpose of an OBDI system is to allow information consumers to query the data using the elements in the ontology as predicates. In the special case where the organization manages a single data source, the term ontology-based data access (ODBA) system is used

Evaluación cuantitativa del riesgo microbiológico por consumo de agua en San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, México

Galdos-Balzategui, A., Carmona de la Torre, J., SánchezPérez, H. J., Morales-López, J. J., Torres Dosal, A., & GómezUrbina, S. (enero-febrero, 2017). Evaluación cuantitativa del riesgo microbiológico por consumo de agua en San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, México. Tecnología y Ciencias del Agua, 8(1), 133-153. La ciudad de San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, México, carece de información sobre la calidad microbiológica del agua del sistema municipal de distribución de agua potable. Se desconocen, por tanto, los riesgos derivados de su ingesta y el impacto que supone para la salud pública. El presente estudio evaluó el riesgo por contaminación microbiana de las fuentes de agua del Sistema de Agua Potable y Alcantarillado Municipal (SAPAM) mediante la aplicación de una Evaluación Cuantitativa del Riesgo Microbiológico (ECRM). Se analizó la contaminación por Escherichia coli en muestras de agua de todas las fuentes. Para calcular la ECRM y la carga de enfermedad, se estimó la concentración de cuatro patógenos de referencia (E. coli O157:H7, Campylobacter, rotavirus y Cryptosporidium) utilizando datos publicados de la razón de éstos con E. coli. Todas las fuentes presentaron contaminación fecal. La probabilidad de infección anual fue mayor que el nivel de seguridad establecido por la EPA en todos los patógenos. La suma de la carga de enfermedad fue de 2.40 x 10-3 años de vida ajustados por discapacidad (AVAD) por persona/año, mucho más elevada que el nivel de referencia de la OMS. El riesgo no fue homogéneo para toda la población, se encontraron diferencias en la exposición y riesgo, según fuente de abastecimiento. Este estudio demuestra la necesidad de implementar mejoras en el sistema de distribución de agua potable que reduzcan el riesgo para al salud de la población

Uso de microalgas como constituyentes parciales del alimento balanceado para engorda de tilapia (Oreochromis niloticus)//The use of microalgae as partial constituents of growout feeds for tilapia (Oreochromis niloticus)

El presente estudio evaluó el uso de las microalgas Arthrospira sp., Chlorella sp., Isochrysis sp. y Nannochloropsis sp. como constituyentes parciales del alimento balanceado para tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus) bajo condiciones de cultivo estático en un estudio de 53 días de duración. Un alimento balanceado comercial con contenido de proteína cruda de 45% se utilizó como dieta control, mismo que se molió finamente y se reconstituyó incorporando, a un nivel de inclusión de 25% de la dieta, las harinas de las cuatro especies de microalgas mencionadas. Se analizaron parámetros de producción de tilapia, incluyendo índices de crecimiento y supervivencia, mediante análisis de varianza. Los índices de crecimiento, tales como peso final, peso ganado y porcentaje de peso ganado de los peces alimentados con las microalgas Arthrospira sp. y Chlorella sp., así como la supervivencia, fueron similares a los de aquellos que recibieron la dieta control, mientras que el crecimiento de peces alimentados con las microalgas Isochrysis sp. y Nannochloropsis sp. fue inferior estadísticamente. Estos resultados indican que Arthrospira sp. y Chlorella sp. pueden ser incorporadas a un nivel de 25% del alimento balanceado sin afectar significativamente el crecimiento o la supervivencia de O. niloticus.ABSTRACTIn the present study, the use of the microalgae Arthrospira sp., Chlorella sp., Isochrysis sp., and Nannochloropsis sp., as partial constituents in diets for Nile tilapia (Oreochromis niloticus), was evaluated in static tanks in a 53-day study, with a commercial diet containing 45% crude protein as a control treatment. Then, we replaced 25% of this diet with meals derived from each of the four microalgae species. Analysis of variance was employed to evaluate fish growth performance. Fish fed the diets with the microalgae Arthrospira sp. and Chlorella sp. had growth performance comparable to that of fish fed the control diet, as evaluated by growth parameters, such as final weight, weight gain, and percent weight gain, among others. In contrast, growth of fish receiving the microalgae Isochrysis sp. and Nannochloropsis sp. was significantly lower. Results of the present study indicate that the use of 25% of Arthrospira sp. and Chlorella sp. meals incorporated into the diet of O. niloticus does not compromise fish development, although there seems to be an opportunity for a further increment of the replacement level

Purification and biochemical characterization of four iron superoxide dismutases in Trypanosoma cruzi

Four superoxide dismutase (SOD) activities (SOD I, II, III, and IV) have been characterized in the epimastigote form of Trypanosoma cruzi . The total extract was subjected to two successive ammonium sulphate additions between 35 and 85%, and the resulting fraction was purified using two continuous chromatography processes (ion exchange and filtration). Enzymes were insensitive to cyanide but sensitive to hydrogen peroxide, properties characteristic of iron-containing SODs. The molecular masses of the different SODs were 20 kDa (SOD I), 60 kDa (SOD II), 50 kDa (SOD III) and 25 kDa (SOD IV), whereas the isoelectric points were 6.9, 6.8, 5.2 and 3.8, respectively. Subcellular location and digitonin experiments have shown that these SODs are mainly cytosolic, with small amounts in the low- mass organelles (SOD II and SOD I) and the mitochondrion (SOD III), where these enzymes play an important role in minimizing oxidative damage.Financial support: CGL2006-27889-E/BOS, Ministerio de Ciencia y Tecnología

Rewriting Conjunctive Queries under Description Logic Constraints

Abstract. We consider the problems of conjunctive query answering and rewriting under Description Logic constraints. We present a query rewriting algorithm for ELHI knowledge bases, and use it to show that query answering in this setting is PTime-complete w.r.t. data complexity. We show that our algorithm is worst-case optimal for languages with data complexity of query answering ranging from LogSpace to PTimecomplete.